《谍海风云》将故事背景设定在1941年的上海，这座被称为“孤岛”的城市正处于多方势力角力的漩涡中心。美国海军情报局特工索姆斯（约翰·库萨克饰）以德国先驱报驻上海记者的公开身份为掩护，暗中调查好友康纳被暗杀的真相。他频繁出入社会名流的酒会，借助同纳粹工程师穆勒的往来获取情报，同时与日本情报官员、上海黑帮以及各国间谍展开周旋。

在调查过程中，索姆斯结识了神秘而优雅的女子安娜（巩俐饰），两人之间逐渐萌生复杂而危险的情感。随着线索层层推进，他发现康纳之死背后隐藏着更大的阴谋，涉及日军南进战略、情报网络争夺以及多方势力的利益交换。影片以悬疑紧张的叙事节奏，展现了一个特工在战争阴云下如何凭借智慧与勇气，在真假难辨的谍海中寻找真相，最终卷入一场影响二战走向的关键博弈。