《渔村小医神》讲述平凡渔村青年林小海的逆袭传奇。一次海难中，他意外获得上古医仙传承，从此拥有起死回生的神奇医术。面对乡亲们的疑难杂症，他妙手回春；面对欺压百姓的恶霸，他巧妙惩治。随着医术精进，林小海的身世之谜逐渐浮出水面，原来他竟是失散多年的医学世家传人。

都市权贵闻讯而来，用金钱与权势威逼利诱，企图夺取他的医术秘方。林小海坚守本心，不为所动，毅然回到渔村。他带领乡亲们发展海产养殖、开办医馆，将贫穷渔村变成远近闻名的富裕之地。期间，他与善良美丽的村花苏小婉相知相守，收获真挚爱情。最终，林小海不仅成为受人敬仰的小医神，更用行动诠释了医者仁心的真谛。