《南少林三十六房》以清朝乾隆年间为背景，讲述少林寺遭焚后，至善禅师逃至南少林开设三十六房，广收门徒。方世玉拜入其门下，与严咏春、胡惠乾等师兄弟习武成长，卷入宫廷与江湖的纷争。

该剧由享有盛誉的袁祥仁率领袁家班设计武打场面，完全依靠真功夫，彻底抛弃电脑特技，回归李小龙时代的硬派打斗风格。吴京饰演方世玉，袁咏仪出演女主角，两人以真实历史人物为基底，演绎一段跨越时空的刻骨铭心之恋。

宫廷、江湖、少林寺，复仇、红尘、未了缘，多方势力交织，一场剪不断理还乱的乱世儿女情由此展开。